Соединения Холлидея в модели HC Blume-Capel в «одном случае» на ДНК
https://doi.org/10.17586/2220-8054-2021-12-5-563-568
Аннотация
Мы рассматриваем ДНК как конфигурацию модели HC Blume–Capel и встраиваем ее в путь дерева Кэли. Для изучения термодинамических свойств модели ДНК мы опишем соответствующие трансляционно-инвариантные меры Гиббса (TIGM) модели на дереве Кэли. Показано, что при k >= 2 для любой температуры T > 0 существует единственный ТИГМ. Используя эти результаты, мы изучаем распределения ДНК контактов Холлидея. Для очень высоких и очень низких температур мы приводим стационарные распределения и типичные конфигурации контактов Холлидея.
Список литературы
1. Alberts B., Johnson A., et al. Molecular biology of the cell, 4th edn., Garland Science, New York, 2002.
2. Holliday R. A mechanism for gene conversion in fungi. Genet Res., 1964, 5, P. 282–304.
3. Khatamov N.M. Holliday junctions in the Blume–Capel model of DNA. Theoretical and Mathematical Physics, 2021, 3 (206), P. 383–390.
4. Rozikov U.A. Tree-hierarchy of DNA and distribution of Holliday junctions. J. Math. Biol., 2017, 75, P. 1715–1733.
5. Rozikov U.A. Holliday junctions for the Potts model of DNA. Algebra, Complex Analysis, and Pluripotential Theory, 2018, 264, P. 151–165.
6. Rozikov U.A. Thermodynamics of interacting systems of DNA molecules. Theoretical and Mathematical Physics, 2021, 2 (206), P. 174–183.
7. Rozikov U.A. Thermodynamics of DNA-RNA renaturation. Inter. Jour. Geom. Methods Mod. Phys., 2021, 6 (18), 2150096.
8. Cirillo E.N., Olivieri E. Metastabilty and nucleation for the Blume–Capel model.Different mechanisms of transition. Journal of Statistical Physics, 1996, 83, P. 473–554.
9. Khatamov N.M., Khakimov R.M. Translation-invariant Gibbs measures for the Blume–Capel model on a Cayley tree. JMAG, 2019, 2 (15), P. 239–255.
10. Khatamov N.M. Translation-invariant extreme Gibbs measures for the Blume–Capel model with a wand on a Cayley tree. Ukrains’kyi Matematychnyi Zhurnal, 2020, 4 (72), P. 540–556.
11. Rozikov U.A., Ishankulov F.T. Description of periodic p-harmonic functions on Cayley trees. Nonlinear Diff. Equ. Appl., 2010, 2 (17), P. 153– 160.
12. Rozikov U.A. Gibbs measures on Cayley trees. World Scientific Publishing, Singapore, 2013.
13. Georgii H.O. Gibbs measures and phase transitions. De Gruyter stadies in Math, Berlin, 1988.
Рецензия
Для цитирования:
Khatamov N.M. Соединения Холлидея в модели HC Blume-Capel в «одном случае» на ДНК. Наносистемы: физика, химия, математика. 2021;12(5):563-568. https://doi.org/10.17586/2220-8054-2021-12-5-563-568
For citation:
Khatamov N.M. Holliday junctions in the HC Blume–Capel model in “one case” on DNA. Nanosystems: Physics, Chemistry, Mathematics. 2021;12(5):563-568. https://doi.org/10.17586/2220-8054-2021-12-5-563-568
Просмотров:
124
Послать статью по эл. почте 